Bioteknologi ternyata telah diaplikasikan sejak jauh sebelum zaman masehi, sekitar 9000 tahun SM.
Saat itu, manusia telah menggunakan organisme hidup untuk kepentingan mereka, dengan cara mengaplikasikan ilmu bioteknologi untuk membuat sesuatu yang baru dari bahan-bahan yang sudah ada sebelum nya, seperti contoh nya adalah sebagai berikut :
- Pada tahun 9.000 SM : pembuatan yogurt dari susu sapi
- Pada tahun 6.000-5.000 SM : awal pembuatan bir
- Pada tahun 4.000 SM : pembuatan keju dari susu sapi
Adapun bioteknologi itu sendiri yang dipakai untuk membuat produk olahan makanan tersebut adalah fermentasi.
