- Bioteknologi mikrobial merupakan aplikasi dari Bioteknologi yang tertua : penggunaan mikroba berupa ragi untuk membuat bir dan wine (anggur).
- Dengan memanipulasi mikroba -> dapat menghasilkan enzim yang lebih baik dan organisme untuk membuat makanan, memudahkan proses produksi dan membuat proses dekontaminasi untuk limbah produksi agar lebih efisien lagi.
- Mikroba juga digunakan untuk kloning dan memproduksi protein-protein penting yang digunakan sebagai obat untuk manusia, meliputi insulin dan hormon pertumbuhan (growth hormone).